Składniki pokarmowe, niezbędne do życia pierwiastki, takie jak: węgiel, azot, fosfor i potas. Nadmiar lub niedomiar biogenów może prowadzić do zaburzeń w funkcjonowaniu organizmów. Duża ilość związków odżywczych w wodach powierzchniowych może powodować  masowe zakwity glonów i sinic. Źródłem biogenów w wodach powierzchniowych są np. ścieki komunalne i spływy z pól uprawnych.